有些表的数据量增长很快,对应SQL扫描了很多无效数据,导致SQL慢了下来,通过确认之后,这些大表都是一些流水、记录、日志类型数据,只需要保留1到3个月,此时需要对表做数据清理实现瘦身。
这篇文章我会从InnoDB存储空间分布,delete对性能的影响,以及优化建议方面解释为什么不建议delete删除数据。
InnoDB存储架构
从这张图可以看到,InnoDB存储结构主要包括两部分:逻辑存储结构和物理存储结构。
逻辑上是由表空间tablespace —> 段segment或者inode —> 区Extent ——>数据页Page构成,Innodb逻辑管理单位是segment,空间分配的最小单位是extent,每个segment都会从表空间FREE_PAGE中分配32个page,当这32个page不够用时,会按照以下原则进行扩展:如果当前小于1个extent,则扩展到1个extent;当表空间小于32MB时,每次扩展一个extent;表空间大于32MB,每次扩展4个extent。
物理上主要由系统用户数据文件,日志文件组成,数据文件主要存储MySQL字典数据和用户数据,日志文件记录的是data page的变更记录,用于MySQL Crash时的恢复。
Innodb表空间
InnoDB存储包括三类表空间:系统表空间,用户表空间,Undo表空间。
系统表空间: 主要存储MySQL内部的数据字典数据,如information_schema下的数据。
用户表空间: 当开启innodb_file_per_table=1时,数据表从系统表空间独立出来存储在以table_name.ibd命令的数据文件中,结构信息存储在table_name.frm文件中。
Undo表空间: 存储Undo信息,如快照一致读和flashback都是利用undo信息。
从MySQL 8.0开始允许用户自定义表空间,具体语法如下:
CREATE TABLESPACE tablespace_name ADD DATAFILE 'file_name' #数据文件名 USE LOGFILE GROUP logfile_group #自定义日志文件组,一般每组2个logfile。 [EXTENT_SIZE [=] extent_size] #区大小 [INITIAL_SIZE [=] initial_size] #初始化大小 [AUTOEXTEND_SIZE [=] autoextend_size] #自动扩宽尺寸 [MAX_SIZE [=] max_size] #单个文件最大size,最大是32G。 [NODEGROUP [=] nodegroup_id] #节点组 [WAIT] [COMMENT [=] comment_text] ENGINE [=] engine_name
这样的好处是可以做到数据的冷热分离,分别用HDD和SSD来存储,既能实现数据的高效访问,又能节约成本,比如可以添加两块500G硬盘,经过创建卷组vg,划分逻辑卷lv,创建数据目录并mount相应的lv,假设划分的两个目录分别是/hot_data 和 /cold_data。
这样就可以将核心的业务表如用户表,订单表存储在高性能SSD盘上,一些日志,流水表存储在普通的HDD上,主要的操作步骤如下:
#创建热数据表空间 create tablespace tbs_data_hot add datafile '/hot_data/tbs_data_hot01.dbf' max_size 20G; #创建核心业务表存储在热数据表空间 create table booking(id bigint not null primary key auto_increment, …… ) tablespace tbs_data_hot; #创建冷数据表空间 create tablespace tbs_data_cold add datafile '/hot_data/tbs_data_cold01.dbf' max_size 20G; #创建日志,流水,备份类的表存储在冷数据表空间 create table payment_log(id bigint not null primary key auto_increment, …… ) tablespace tbs_data_cold; #可以移动表到另一个表空间 alter table payment_log tablespace tbs_data_hot;
Inndob存储分布
创建空表查看空间变化
mysql> create table user(id bigint not null primary key auto_increment, -> name varchar(20) not null default '' comment '姓名', -> age tinyint not null default 0 comment 'age', -> gender char(1) not null default 'M' comment '性别', -> phone varchar(16) not null default '' comment '手机号', -> create_time datetime NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP COMMENT '创建时间', -> update_time datetime NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP ON UPDATE CURRENT_TIMESTAMP COMMENT '修改时间' -> ) engine = InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COMMENT '用户信息表'; Query OK, 0 rows affected (0.26 sec)
# ls -lh user1.ibd -rw-r----- 1 mysql mysql 96K Nov 6 12:48 user.ibd
设置参数innodb_file_per_table=1时,创建表时会自动创建一个segment,同时分配一个extent,包含32个data page的来存储数据,这样创建的空表默认大小就是96KB,extent使用完之后会申请64个连接页,这样对于一些小表,或者undo segment,可以在开始时申请较少的空间,节省磁盘容量的开销。
# python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0000> page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 6: #总共分配的页数 Freshly Allocated Page: 2 #可用的数据页 Insert Buffer Bitmap: 1 #插入缓冲页 File Space Header: 1 #文件空间头 B-tree Node: 1 #数据页 File Segment inode: 1 #文件端inonde,如果是在ibdata1.ibd上会有多个inode。
插入数据后的空间变化
mysql> DELIMITER $$ mysql> CREATE PROCEDURE insert_user_data(num INTEGER) -> BEGIN -> DECLARE v_i int unsigned DEFAULT 0; -> set autocommit= 0; -> WHILE v_i < num DO -> insert into user(`name`, age, gender, phone) values (CONCAT('lyn',v_i), mod(v_i,120), 'M', CONCAT('152',ROUND(RAND(1)*100000000))); -> SET v_i = v_i+1; -> END WHILE; -> commit; -> END $$ Query OK, 0 rows affected (0.01 sec) mysql> DELIMITER ; #插入10w数据 mysql> call insert_user_data(100000); Query OK, 0 rows affected (6.69 sec)
# ls -lh user.ibd -rw-r----- 1 mysql mysql 14M Nov 6 10:58 /data2/mysql/test/user.ibd # python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0001> #增加了一个非叶子节点,树的高度从1变为2. ........................................................ page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 896: Freshly Allocated Page: 493 Insert Buffer Bitmap: 1 File Space Header: 1 B-tree Node: 400 File Segment inode: 1
delete数据后的空间变化
mysql> select min(id),max(id),count(*) from user; +---------+---------+----------+ | min(id) | max(id) | count(*) | +---------+---------+----------+ | 1 | 100000 | 100000 | +---------+---------+----------+ 1 row in set (0.05 sec) #删除50000条数据,理论上空间应该从14MB变长7MB左右。 mysql> delete from user limit 50000; Query OK, 50000 rows affected (0.25 sec) #数据文件大小依然是14MB,没有缩小。 # ls -lh /data2/mysql/test/user1.ibd -rw-r----- 1 mysql mysql 14M Nov 6 13:22 /data2/mysql/test/user.ibd #数据页没有被回收。 # python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0001> ........................................................ page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 896: Freshly Allocated Page: 493 Insert Buffer Bitmap: 1 File Space Header: 1 B-tree Node: 400 File Segment inode: 1 #在MySQL内部是标记删除,
mysql> use information_schema; Database changed mysql> SELECT A.SPACE AS TBL_SPACEID, A.TABLE_ID, A.NAME AS TABLE_NAME, FILE_FORMAT, ROW_FORMAT, SPACE_TYPE, B.INDEX_ID , B.NAME AS INDEX_NAME, PAGE_NO, B.TYPE AS INDEX_TYPE FROM INNODB_SYS_TABLES A LEFT JOIN INNODB_SYS_INDEXES B ON A.TABLE_ID =B.TABLE_ID WHERE A.NAME = 'test/user1'; +-------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ | TBL_SPACEID | TABLE_ID | TABLE_NAME | FILE_FORMAT | ROW_FORMAT | SPACE_TYPE | INDEX_ID | INDEX_NAME | PAGE_NO | INDEX_TYPE | +-------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ | 1283 | 1207 | test/user | Barracuda | Dynamic | Single | 2236 | PRIMARY | 3 | 3 | +-------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ 1 row in set (0.01 sec) PAGE_NO = 3 标识B-tree的root page是3号页,INDEX_TYPE = 3是聚集索引。 INDEX_TYPE取值如下: 0 = nonunique secondary index; 1 = automatically generated clustered index (GEN_CLUST_INDEX); 2 = unique nonclustered index; 3 = clustered index; 32 = full-text index; #收缩空间再后进行观察
MySQL内部不会真正删除空间,而且做标记删除,即将delflag:N修改为delflag:Y,commit之后会会被purge进入删除链表,如果下一次insert更大的记录,delete之后的空间不会被重用,如果插入的记录小于等于delete的记录空会被重用,这块内容可以通过知数堂的innblock工具进行分析。
Innodb中的碎片
碎片的产生
我们知道数据存储在文件系统上的,总是不能100%利用分配给它的物理空间,删除数据会在页面上留下一些”空洞”,或者随机写入(聚集索引非线性增加)会导致页分裂,页分裂导致页面的利用空间少于50%,另外对表进行增删改会引起对应的二级索引值的随机的增删改,也会导致索引结构中的数据页面上留下一些"空洞",虽然这些空洞有可能会被重复利用,但终究会导致部分物理空间未被使用,也就是碎片。
同时,即便是设置了填充因子为100%,Innodb也会主动留下page页面1/16的空间作为预留使用(An innodb_fill_factor setting of 100 leaves 1/16 of the space in clustered index pages free for future index growth)防止update带来的行溢出。
mysql> select table_schema, -> table_name,ENGINE, -> round(DATA_LENGTH/1024/1024+ INDEX_LENGTH/1024/1024) total_mb,TABLE_ROWS, -> round(DATA_LENGTH/1024/1024) data_mb, round(INDEX_LENGTH/1024/1024) index_mb, round(DATA_FREE/1024/1024) free_mb, round(DATA_FREE/DATA_LENGTH*100,2) free_ratio -> from information_schema.TABLES where TABLE_SCHEMA= 'test' -> and TABLE_NAME= 'user'; +--------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | table_schema | table_name | ENGINE | total_mb | TABLE_ROWS | data_mb | index_mb | free_mb | free_ratio | +--------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | test | user | InnoDB | 4 | 50000 | 4 | 0 | 6 | 149.42 | +--------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ 1 row in set (0.00 sec)
其中data_free是分配了未使用的字节数,并不能说明完全是碎片空间。
碎片的回收
对于InnoDB的表,可以通过以下命令来回收碎片,释放空间,这个是随机读IO操作,会比较耗时,也会阻塞表上正常的DML运行,同时需要占用额外